ちょっと言っていることがよくわからないので質問です。
・自力解析ですか?
・ポリゴン表示はどのような手段?
・テクスチャのごちゃごちゃとはポリゴンに貼った状態?テクスチャ画像そのものが正常ではない?
多分、この文章からだと自力解析ではなく誰かのつくったツールを使用した
もしくは流出したオフィシャルのミドルウェアを不正に使用している
そんな気がしますがどうでしょう?
テクスチャは非圧縮、Swizzle無しのインデックスカラー形式です。
4bitまたは8bitピクセルで16bit、24bit、32bitRGBAが存在してたような記憶があります。
igbはチェンクを追うことによりデータの情報を得ることができます。
どこにピクセルとカラー情報があり、どのようなデータ構造なのか埋められています。
一応、過去に解析した結果をこちらで公開してます。
http://www.cute.or.jp/~makuchan/pce/diva2.html
テクスチャ情報についてはigTextureAttrを参照してください。